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自從基因晶片問世之後，對基因體之研究帶來突破性之發展，很多與疾病有關的基因變化可用基因晶片來分析。 然而，從基因的變化到其與疾病的關係，仍無法從基因晶片的分析得知。 因此，功能基因體學或蛋白質體學變成基因定序之後最重要的工作。
人體中的蛋白質有一半以上是帶有醣類的醣蛋白，這些醣蛋白上的醣類到底扮演何種角色，仍然是科學家們努力的課題。如果有有效的研究工具，對於這個研究會有關鍵性的助力。“醣晶片”可以用來快速分析這些醣分子之功能，尤其與蛋白質作用之關係；也可對癌細胞或病毒的存在作快速的檢測。 但目前醣晶片之製作所面臨的瓶頸，在於多醣分子的合成相當困難，同時很難定量晶片上的醣分子。
翁啟惠所領導的團隊，用其著名的“一鍋化”多醣合成技術，就解決了這個多醣分子合成的難題。該團隊用簡短的步驟，就可以合成複雜的癌症抗原及病毒所認識的多醣分子。 然後，將此分子藉由對特殊波長(337nm)之光敏感鏈，連接到矽晶片上。如此製成的醣晶片可用質譜儀直接分析晶片上之醣分子的存在。 因為操作質譜儀的同時，其所發出的雷射光可將晶片上的醣分子飛出來直接分析。因此可做好品質管制，在醫療診斷時，可以成為有效的工具。
翁啟惠說：「將來，希望能結合半導體技術及基因體中心的多醣合成及新質譜技術，使醣晶片之製作技術更臻完善，目前一毫克的多醣分子可製作一億個醣晶片，而一個晶片可有上千種不同的醣分子。在進行醣蛋白及多醣分子之功能研究上，醣晶片將會是一個相當重要的工具。」
此晶片製作技術已經授權給一家生技公司，在台灣開發醣晶片。
詳細資料請參考下列文獻: Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 2753-2757. 或該期刊網站